◇章節簡說：
Ｃｈａｐｔｅｒ１：時間跳躍のパラノイア
對整個故事人際關係的展開，以及對電話微波爐（暫）奇妙的特性進行初步的研究。
為什麼本要解凍的卡啦雞會變成冷凍狀態，香蕉為什麼會變成嘔吐狀的嘔吐香蕉，而為什麼在之前オカリン所傳送給ダル的「紅莉栖被殺」的簡訊，會傳回一週前，也就是傳回過去。另外又為什麼，在發生了放電現象時電話微波爐（暫）的質量會增加……
一切的謎題，在最後オカリン的妄想之下化作了結論－－電話微波爐（暫）正是夢幻的時間機器。
Ｃｈａｐｔｅｒ２：空理彷徨のランデヴー
在２０００年曾經一度出現的，自稱時間旅行者的「約翰．泰坦」再度在２０１０年現身。可是，除了オカリン以外的人們，都不曾記得泰坦曾經在２０００年出現過。在許多疑雲的堆積下，由於泰坦所說的未來是由「ＳＥＲＮ（現實的歐洲原子核研究機構）」利用時間機器而作成的獨裁統治，因此オカリン唆使ダル駭進ＳＥＲＮ的伺服器之中，在那裡面他們看到了龐大的陰謀存在著。另外在ＳＥＲＮ的網路資料庫之中，還存在著一個謎一般的程式語言……
就約翰．泰坦所說的，該程式語言只有如今夢幻般的古董ＰＣ－ＩＢＮ５１００的隱藏功能才能破解。
同時オカリン也想起了在秋葉原的街上遇見的，那對ＩＢＮ５１００有著強烈執著的謎一般的女性「桐生萌郁」。
在各方好友支援下，オカリン終於在柳林神社中找到了ＩＢＮ５１００。
Ｃｈａｐｔｅｒ３：蝶翼のダーバージェンス
ＳＥＲＮ如此龐大的研究機關，到目前為止仍然無法突破使卡爾黑洞中裸露的特異點完全安定的方法，因此在無數的實驗之中，造就了無數的「果凍人」到過去。可是相反，只能將簡訊傳回過去的電話微波爐（暫）沒有這個風險，因此オカリン決定開始第一次改變過去的實驗。將這次ロト６的３等獎中獎碼送回去給過去的自己如此的方式，他們啟動了電話微波爐（暫），將命名為Ｄメール的簡訊傳回過去。
就在這同時，一股異樣的感覺朝オカリン襲來。簡訊確實送到過去了……可是－－
－－實驗過後，沒有人記得實驗發生過，有的只是ルカ子來到了未來道具研究所，並敘述了一週前オカリン叫他去買ロト６，雖然因為一碼錯誤而中了４獎，但是還是驗證了Ｄメール能夠改變過去。不過オカリン卻對此完全沒有印象。
但是令人在意的是，為什麼其他人對實驗的事情完全不知情，但是オカリン卻記得一清二楚？
在泰坦的理論敘述下，在世界線變動的同時，由於因果重新構築，因此每個人被賦予了符合那因果的過去及記憶，可オカリン的記憶卻是與上一條世界線的記憶是連結的……
現在的定義是由人類去觀測的，但是人類無法觀測到世界線的變動。可若是，能夠觀測世界線的人出現了的話呢……？
Ｃｈａｐｔｅｒ４：夢幻のホメオスタシス
繼續進行實驗的他們，仍然不知道自己無謀的改變過去，所造成的蝴蝶效應是多麼的龐大……
後續接連改變了ルカ子、フェイリス、萌郁的過去，同時也為了留下沒有見到父親就離開秋葉原的鈴羽，使用了Ｄメール改變了過去……可是他們不知道，隱藏在這些思念下的東西，只是殘酷的命運而已。
由於不斷的改變過去所造成的蝴蝶效應，本來應該存在的ＩＢＮ５１００…消失了……
Ｃｈａｐｔｅｒ５：時空境界のドグマ
無意間，ダル發現了這棟大樓底下的光纖網路能夠直達身在法國的ＳＥＲＮ研究本部，並能夠靠他超級駭客的能力遠隔操作微型黑洞，以此為契機，在オカリン的發想下，紅莉栖開始對電話微波爐（暫）著手進行成為記憶時間跳躍機器的改造。
專攻腦科學的她，藉オカリン的發想，思考出了，將記憶靠黑洞壓縮送回過去給接聽到手機的人。當然那個接起電話的人必須是自己，不然的話會對他人造成深刻的人格障礙。
終於在８月１３號下午時，夢幻的時間機器完成了……但是在之前オカリン曾經接到兩通恐嚇電話，示意他知道的太多了……因此他們準備在隔天將記憶時間跳躍機器公諸於世，交給其他研究機關……
可是，就在當晚的慶功宴當中，由她帶領的ＳＥＲＮ的傭兵集團闖進了研究所之中……
她，桐生萌郁要求オカリン、ダル及紅莉栖跟她一起走，而知情卻又沒有用處的まゆり……
因為不需要她，所以殺了也沒關係。
在オカリン悲憤的怒吼之下，原本說有事要先回去的鈴羽出現在門口，並且帶給了オカリン進行記憶時間跳躍的機會。
這樣，真的好嗎－－？現在的オカリン也想不了這麼多了。
Ｃｈａｐｔｅｒ６：形而上のネクローシス
まゆり死了。まゆり死了。まゆり死了。まゆり死了。
不管進行了幾次，不管回朔了幾次，就算迴避了這種死法，還有另一種死法在等著她。世界期望著她的死，不管過程是什麼，椎名まゆり將會在今晚死去，這就是這條世界線收束的結果。
最終，オカリン變得像活死人一樣，想不到辦法、找不到出路……期待著他人的幫助……
就在這時紅莉栖出現在他的面前，並且給他了建議及勇氣，讓他能再度站起來反抗命運。
因此オカリン再次回到了過去，並對那個時間的紅莉栖說明情況。同時在樓下不小心聽到兩人談話的鈴羽飛奔似的重樓下跑了開來，オカリン聞到了陰謀的味道因此跟了上去……沒想到，那個鈴羽就是－－
－－約翰．泰坦。
原來鈴羽是為了改變未來ＳＥＲＮ的獨裁統治而回到２０１０年的未來人，而敵視紅莉栖的原因也是由於未來的紅莉栖協助ＳＥＲＮ製造時間機器的關係。聽到這裡連紅莉栖自己都嚇了一大跳，畢竟現在的自己才想要揭發ＳＥＲＮ瞞著世人開發時間機器，但未來自己卻又幫著ＳＥＲＮ製造時間機器。看起來ＳＥＲＮ是一定程度的把握著紅莉栖和其他研究者的弱點來強制他們開發時間機器。
鈴羽表示如果那天沒有見到父親就離開的話，說不定現在ＩＢＮ５１００就在オカリン他們的手中，因此相當懊悔，可是由於之前的雷雨，人造衛星…時間機器已經不能再運作了……
因此オカリン再度回到了８月１１號，並使大家分工合作，讓有著製作電話微波爐技術的ダル修復時光機，まゆり尋找鈴羽的父親，紅莉栖繼續製作時間跳躍機器，終於……時間機器修復完成了。
同時，まゆり也發表了她在這兩天內對鈴羽父親搜索的重大發現。
原來鈴羽的父親便是ダル！！在感人的劇情下，鈴羽乘著只能前往過去的時間機器獨自一人回到了過去……
可是…在那未來等著オカリン等人的，卻是錯綜複雜的悲劇……
由於時間機器的修復不完全，回到１９７５年的鈴羽失去了記憶２４年，在最後一年的時候，認為這種人生根本沒有意義……沒有達成使命根本沒有意義……
於是上吊自殺了。
如果說，那天オカリン沒有尾行鈴羽，讓鈴羽就在那天回去的話……就不會構成這樣的情況發生了……
於是，オカリン對著電話微波爐發送了Ｄメール……試圖讓過去的自己不要尾行鈴羽……
而在送信成功的那一瞬間……リーディング・シュタイナー發動了，世界線的改變被觀測到，オカリン到了因果再構築的世界線上……
◇鈴羽Ｅｎｄ：不可逆のリブート
Ｃｈａｐｔｅｒ７：虚像歪曲のコンプレックス
雖然改變了世界線，但是還是沒能迴避まゆり的死亡，頂多只能說延長了一天而已，因此オカリン再度與紅莉栖談話。以紅莉栖的說法，必須讓過去所傳出的Ｄメール全部取消掉，重置蝴蝶效應才能再度將ＩＢＮ５１００入手，因此オカリン找上當初傳送Ｄメール時沒有公開內容的フェイリス。
這個世界線的フェイリス並沒有在メインクイーン﹢ニャン２打工，只是まゆり打雷ネット認識的朋友而已。跟之前的世界線一樣フェイリス打雷ネット的實力仍然是超群，而オカリン找上了那樣的フェイリス。
但是好巧不巧剛好今天是雷ネット夏季大賽冠亞戰的決戰當日，因此オカリン花了好長一段時間才找到フェイリス。
可是，在家中的フェイリス卻一個人獨自的消沉著，但在聽到時間機器這個單語的時候，卻又向返魂回來那樣要求オカリン給她使用。
原來在今天的大賽中，對手團隊使用了卑鄙的手段妨礙決鬥中的フェイリス導致了她的敗北，フェイリス希望オカリン能夠回到過去告知她注意對手，如此的話フェイリス自稱一定能想起之前世界線的記憶。
抱著一絲希望オカリン再次進行了跳躍回到了當天早上，可沒想到フェイリス卻不相信他。直到忽然殺出的對手４℃出來亂，オカリン又靠著未來記憶中４℃頭上的十圓打了他好幾次巴掌，才讓フェイリス相信他。
最後由於オカリン的協助，フェイリス果然獲得了勝利。
不過沒想到在歸途中，フェイリス說了可能是未來的自己騙了オカリン，現在她無法想起之前的記憶。正當オカリン消沉的同時，中二的４℃與雜魚們出現在他們兩人的面前，於是兩人在秋葉原展開了一陣逃亡。中間，由於躲在狹小陰暗的空間之中，フェイリス居然想起了過去曾經被綁架事情的同時，連那通Ｄメール的內容也想了起來……
那是一通，讓父親起死回生的簡訊。
解除了危機之後的オカリン，那晚在フェイリス的家中休養。當晚，フェイリス卸下了貓耳，以秋葉留未穂的身分和オカリン對話。留未穂為了救身為好友的まゆり寧願犧牲這場美妙的「夢」……做為她過去一直努力的獎賞，已經夠了……是該讓一切回歸原本樣子的時候了……
於是隔天，岡部倫太郎殺死了フェイリス的父親。
修正了世界的歪曲，使其恢復為那天飛機事故上僅僅一人的死者。
◇フェイリスＥｎｄ：分離喪失のジャメヴュ
Ｃｈａｐｔｅｒ８：自己相似のアンドロギュノス
接著，輪到了ルカ子了。當然，まゆり的死又因此再被延長一天，這也表示越來越脫離目前的世界線了。
過去以Ｄメール傳送有關飲食習慣的訊息到ルカ子母親的ＢＢ摳裡面導致了現在ルカ子真的變成了女的……現在必須將這個歪曲改變過來……
於是オカリン前往柳林神社找ルカ子，想要告訴她衝擊性的事實，結果沒想到卻讓她哭了……
在紅莉栖的分析下，原來ルカ子喜歡上了オカリン……自己喜歡的男生居然把自己當成男的，怎麼想都會很難過吧……
隔天ルカ子便對オカリン作出告白宣言，希望能在這短短的兩天內與她交往。原來在告訴她包括まゆり會死的事實在內形成了這種思考。最後オカリン跑回研究所中，跳躍回了４天前，爭取更多的時間。
同樣的事情重複，ルカ子要求４天內與她交往，而オカリン也答應了。
本來一切應該是草草了事的，去了コミマ之後，ルカ子將母親的ＢＢ摳號碼給了オカリン後，本應就這樣結束了……
難道，為了一個人，就一定得犧牲另一個人的思念嗎？
於是オカリン跳躍回了當天的早上，行動有所變更，兩人的行程從コミマ變成了回到神社一起修行。沒錯……這才是ルカ子所想要的，其實ルカ子早就想起了身為男孩子時的記憶了，她所期待的日常。就跟オカリン期望著他的日常「まゆり」不要消失那樣……對ルカ子來說，真正快樂的不是去コミマ，而是跟オカリン在一起，聊著他的那些中二妄想……
終於，最後的時間到了，オカリン發送了Ｄメール回到過去，因果再構成的瞬間，他身後的那溫暖消失了。
◇るかＥｎｄ：背徳と再生のリング
Ｃｈａｐｔｅｒ９：無限連鎖のアポトーシス
雖然ＩＢＮ５１００沒有回來，不過…終於要抵銷的Ｄメール只剩下一通了，只要能夠將這次的Ｄメール抵銷，オカリン相信ＩＢＮ５１００絕對會回來，雖然目前為止極力避免遇見她，不過是該去見她的時候了……去見桐生萌郁。
可是沒想到，愕然的事實擺在了オカリン的眼前……
那個只是因為一句不必要就能夠對まゆり下殺手的萌郁，好幾次殺了まゆり的萌郁……居然自殺了。
為了釐清事實的真相，オカリン決定回到過去，但是在那之前卻已經先有人啟動了記憶時間跳躍機器！可是在オカリン上樓時卻誰也沒看到，總之還是先做跳躍吧……
於是回到過去的オカリン，前往了萌郁的公寓。可是在裡面的萌郁只是像個活死人一樣不斷的獨自嚷嚷。原來是ＳＥＲＮ在獲得了ＩＢＮ５１００之後便將她捨棄了……
在紅莉栖以捨棄倫理的方式分析給オカリン之後，她認為只要將手機搶過來就好了，反正在這條世界線上萌郁是必死無疑，同時Ｄメール傳送之後，這條世界線上的事情一切都會變成沒發生過……
可是オカリン果然還是無法下殺手，僅僅只是把手機搶了過來而已。不過不管怎麼樣發送訊息，都無法改變世界線的變動，於是他發現了－－
－－當初萌郁發出的應該是變更自己手機型號的簡訊，但是在這條世界線上，萌郁的手機並沒有改變！！
オカリン決定與萌郁決出個高下。最後，在２、３個小時的僵持下，無法負荷身體及心裡負擔的萌郁先認輸了。同時也招出了當初的簡訊內容，可是就算以萌郁的手機傳送出去，リーディング・シュタイナー還是沒有發動。不過オカリン注意到了，若是使用萌郁所極度依賴同時被視為母親般的上司ＦＢ的手機傳送Ｄメール的話，那說不定就會對過去的萌郁造成強大的影響力。
沒錯，萌郁在４天後就會死，這就是這條世界線收束的結果，但是就算會死……在オカリン告訴真相之後的她，萌郁最後還是決定像オカリン一般起身反抗命運，為了見到ＦＢ。
在靠著時間跳躍不斷的尾行的結果下，種種的矛頭都指向了研究所樓下顯像管工房的店長的太太……這到底是怎麼回事呢…？
在隔天早上，オカリン與萌郁一同去拜訪了店長，而紅莉栖澤在外面把風。談話很快的就切入主題……
－－沒想到，ＦＢ竟然是店長！！而綯的母親早就在生產的時候過世了！！
店長身為ラウンダー為了隱藏身分而在簡訊上使用女性口吻，並拿出手槍指向オカリン等人。
オカリン很明白自己不會在這裡死去，因此果敢的利用橋田鈴，也就是回到過去的鈴羽的事情向前了，可是沒想到……
店長居然用著惡役的口氣，對著自己的腦門開了一槍自殺了……
什麼被ＳＥＲＮ利用過之後就會被拋棄……他只是覺得對不起鈴羽，並且想要救萌郁而已……
不過更令人意想不到的事情發生了，本應在隔壁熟睡中的店長的女兒綯居然消失了……
據後來回到萌郁公寓後紅莉栖所說，在事發之後綯頭也不回的就跑出了屋子，就在這同時，公寓的電鈴響了起來。正當オカリン察覺有不對勁時，萌郁已經打開了門－－
－－綯只是說了聲妳好，手中的刀子就刺進了萌郁的胸口之中。
接著綯宣言在１５年後將殺死オカリン，就帶著惡魔般的笑聲揚長而去……
被刺中要害的萌郁只是對オカリン帶著懺悔的表情，流著淚閉上了雙眼。
非常在意綯行動的オカリン決定再次跳躍回今天早上。原來這個綯利用了未來被ＳＥＲＮ回收的記憶時間跳躍機器從１５年後回到了現在，回來殺掉害死她爸爸的萌郁。
而在未來，成為了ラウンダー的綯這１５年間都是為了復仇而活著，終於在１５年後殺死了オカリン，並殺死原本應該是自殺的萌郁。可是這樣一來，每１５年就會回到過去的綯只會品嘗到無盡的復仇而已……
那實在是太過於可悲了……因此，オカリン用了店長的手機傳送Ｄメール給過去的萌郁，為了不讓綯的復仇完成－－
Ｃｈａｐｔｅｒ１０：
世界被再構成的瞬間，オカリン瞬間移動到了街上。
當然這只是他主觀認為自己瞬間移動了。接著他決定前去找萌郁。
經過萌郁一番解釋之後，她表示由上司指示不需要再找ＩＢＮ５１００了。
經過確認後，在這條世界線上萌郁和店長都還活著。
面對再復活的敵人，現在要做的只是使用ＩＢＮ５１００駭進ＳＥＲＮ的伺服器之中，將當初ＳＥＲＮ所攔截到的那通Ｄメール給消除掉就什麼也不用怕了。
◇まゆりＥｎｄ：透明のスターダスト
◇紅莉栖Ｅｎｄ：因果律のメルト
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